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前沿武汉大学病毒学国家重点实验室陈向

发布时间:2018-5-29 18:54:14   点击数:
导语

位点特异性重组在生物中广泛存在并发挥重要的生物学功能,目前对古菌及其病毒中存在的整合元件研究报道不多,且多局限于体外研究。年1月19日,国际学术期刊《NucleicAcidsResearch》(IF=10.)在线发表了病毒学国家重点实验室陈向东教授团队题为AnovelfamilyoftyrosineintegrasesencodedbythetemperatepleolipovirusSNJ2(温和多形性病毒SNJ2编码一类新的酪氨酸家族整合酶)的最新研究成果。研究揭示了一类新的病毒整合酶的特性和作用机制,拓展了人们对自然界中存在的可移动元件种类及位点特异性重组机制多样性的认识。

图示:温和病毒SNJ2整合酶的系统进化分析

研究背景

位点特异性重组过程在三域生物中广泛存在并发挥重要的生物学功能,如参与病毒整合与切离、遗传物质复制与分离、调控基因类型等。目前对古菌及其病毒中存在的整合元件研究报道不多,且受遗传操作系统限制而多局限于体外研究。陈向东教授课题组前期发现,在极端嗜盐古菌Natrinemasp.J7-1染色体上溶原性存在一株温和多形性病毒SNJ2,其基因组能特异性地从宿主染色体上切离、整合,即在胞内以线性整合和游离环化两种动态平衡的形式存在,暗示其上存在着功能精巧、有活性的特异性重组元件(YingLiuetal.,Mol.Microbiol.,,.98(6),–)。

Fig0-1.TwotemperatevirusesSNJ1andSNJ2wereisolatedfromNatrinemasp.J7-1cells.

Fig0-2.OrganizationofSNJ2genome.

研究结果

1.SNJ2编码的新的重组系统特点:本研究证实了SNJ2编码一种新的重组系统,可介导病毒基因组上的特定位点与宿主染色体上位于tRNAMet3’末端的序列之间发生特异性重组,从而在宿主染色体上(即原病毒基因组两端)留下14bp的核心重复序列(图1)。

Figure1.ExcisionandintegrationofSNJ2variantslackingoneormoreORFs.

2.SNJ2的切离和整合功能分析:SNJ2编码的整合酶(IntSNJ2)能够单独催化原病毒从宿主染色体上切离,但对于整合过程,其需要在病毒编码的两个小蛋白,Orf2和Orf3的帮助下高效地完成。编码整合酶及这两个辅助蛋白的三个基因共转录,形成一个操纵子(图2)。

Figure2.TheeffectsofOrf2andOrf3onIntSNJ2-mediatedre







































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