幽门螺杆菌（简称HP）感染诊断有许多方法，如活组织镜检、尿素呼气试验、血清学试验以及多聚酶链反应等。
血清幽门螺旋杆菌检测
幽门螺杆菌感染机体后，体内发生免疫反应，会产生抗体，抽血检测这种抗体就可以知道是否感染，比较简便、快捷。
C14呼吸检测
哺乳动物细胞中是不存在尿素酶的，虽然尿素酶并不只有HP所特有，但是在胃内存在的尿素酶，就是HP存在的证据，因为在胃内罕有其它细菌载黏膜定植。为了检测HP，予受检者口服C14-尿素，如果在胃内存在HP，所产生的尿素酶就会迅速催化C14-尿素水解生成NH4+和HCO3-，后者吸收入血液经肺以14CO2形式呼出，收集呼气标本并测量14CO2，以此就会判断HP感染的存在。C14呼气试验检测仪现以成为国际上公认的HP诊断金标准之一。
血清HP（幽门螺旋杆菌）抗体阳性只是表明患者曾经感染HP，现在患者有没有HP，还不得而知，因为患者如曾经接受过抗感染药物如阿莫西林、氧氟沙星等治疗，也有可能将既往感染的HP杀死，但血清Hp抗体阳性检测仍为阳性。因此，血清HP抗体阳性表明患者曾经感染过HP(现在胃内已无HP）。C13或C14呼气试验（UBT）则是表明HP现在感染的检测方法，如果结果是阳性的，提示目前患者胃中一定存在HP感染。
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