健康的土壤是根系易于生长的、疏松的、具有丰富的团粒化结构的土壤；根系生长所必须的水分、空气和养分都能得到满足。
健康的土壤就是物理性、生物性和化学性都很好的土壤；具体的讲，就是较好的土壤物理结构保证土壤较好的排水性、透气性、保水性和保肥性，且为微生物的繁殖生长创造良好的环境，丰富的、多样化的土壤动物、微生物不断分解土壤中的有机物和矿质颗粒，从而在与植物的互动中一方面为植物生长提供可以利用的速效养分如小分子有机物、磷、钾、钙、镁等，另一方面也促进土壤团粒化结构的形成，使得土壤的物理结构更好，形成良性循环。
影响土壤有六大因素
1、土壤有机质
有机质在土壤中的含量很少，通过我们在全国各地取样测土，有机质的含量只有0.6%-1.8%左右。但是，它对于土壤肥力、作物健康度有着很大的影响。有机质含量丰富的土壤往往表现为透水透气性好、供肥能力强、不容易出现板结以及盐渍化的情况。
土壤中有机质的含量对于作物的产量也有着很大的联系，有机质含量高，作物的产量也相应的高。
2、土壤微生物
作为土壤的活跃组成分，土壤微生物在自己的生活过程中，通过代谢活动的氧气和二氧化碳的交换，以及分泌的有机酸等有助于土壤粒子形成大的团粒结构，最终形成真正意义上的土壤。
土壤微生物的作用非常重要，杂草、作物的枯叶、杂草的烂根以及施入土壤中的粪便都需要微生物才可以腐烂分解，释放出养分，形成腐殖质，进而提高土壤肥力，改善土壤结构。土壤中的有益微生物能够抑制有害菌的生长繁殖，促进作物健壮生长，少得病害。
在农药、化肥被大量滥用的今天，微生物还可以降解土壤中的有机污染物，降低农残危害，帮助土壤恢复健康。
3、土壤中的微量元素
作物的产量是由含量最少的养分决定的，也就是土壤中有一种需要的营养元素缺乏，即使其他的营养物质再大量补充也不会获得良好的产量。当作物不健康时，往往是由于其中的某一个中量元素或微量元素缺失而导致的，而且当作物的各种元素都有充足的补给时，健康的作物就会生产出优质的果实。
4、土壤酸碱度
在酸性的土壤中，土壤中的磷酸容易和铁、铝结合成不溶物而被固定，影响作物对磷的吸收；钾、钙等元素易被过多的氢离子取代而淋湿掉；另外，酸性土壤中铜、锌、锰、硼等微量元素溶解增大，如果再增加微量元素肥料的加入，那么很可能使作物受害。
在碱性土壤中，水溶性磷酸根又易于钙结合成难溶的磷酸钙，降低肥效。还会固定铁、锌等元素，影响作物的吸收。
5、盐分
如果持续向土壤中施加化肥，那么化肥的残渣就会残留在土壤中，土壤全盐含量必会有所升高，如果土壤中全盐含量达到一定范围之后，土壤便会有盐渍化的趋向，同时由于全盐含量升高，土壤溶液浓度过大，将直接影响作物根系的生长。
土壤中的盐分可以反映土壤矿质元素的含量情况，更重要的是，我们可以从中看出我们的土壤是否健康，是否适宜种植作物。如果土壤的盐分过高，轻者作物就会生长不良，严重的会出现作物死亡的现象。
6、有害物质
土壤中既有各种养分、有益微生物，也有很多有害物质，例如重金属等，这些物质大量积累在土壤中，势必会对作物产生危害，影响作物生长。
重金属不仅会影响土壤微生物的活性，还会与某些元素产生拮抗作用，也会影响植物对某些元素的吸收。例如：Zn、Ni、Co等元素能严重妨碍植物对磷的吸收，砷影响植物对钾的吸收，As可直接毒害根系，抑制根系生长，甚至腐烂，影响根系对营养元素的吸收，阻碍水分运输，干扰酶促反应。
