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NatureMethods非抗体依

发布时间:2020-1-14 15:57:31   点击数:
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兮近年来,围绕RNA的m6A修饰研究成为表观遗传领域最热门的研究方向。大量研究发现m6A参与了干细胞分化、动物生长发育、学习与记忆、免疫反应和癌症的发生发展等多种生理过程。鉴定RNA上具体的m6A修饰位点,能帮助我们理解m6A如何通过调控基因表达参与这些生理过程,具有重要的意义。实际上,m6A研究热潮也是由去甲基化酶FTO的鉴定和修饰位点测序鉴定方法的开发掀起的。年,DominissiniD和MeyerKD分别在Nature和Cell发表基于m6A抗体开发的高通量m6A位点鉴定技术——MeRIP-Seq。该方法以及其衍生的m6A-LAIC-Seq和m6Ami-CLIP等,在m6A研究中得到了广泛的应用。然而,MeRIP-Seq存在局限性。1、需要投入大量的RNA,不适合量少珍贵的样品,比如胚胎和病理样品。2、m6A抗体会识别与m6A类似结构的修饰,比如m6Am,特异性不高。3、抗体价格昂贵以及建库耗时长。因此,需要开发简单、灵敏性和特异性更高的m6A检测方法。年7月,中山大学骆观正教授和以色列魏茨曼科学研究学院SchragaSchwartz教授分别在ScienceAdvance和Cell发表非抗体依赖的m6A测序方法,其原理都是利用能够识别m6A的限制性内切酶MazF对RNA进行切割,通过分析酶切位点在测序reads的内部还是端点来鉴定m6A修饰位点(详见BioArt报道:Cell+SciAdv共同







































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