目前制备胶原蛋白肽的主要方法有化学法和酶解法。化学法是利用酸、碱等化学试剂促进胶原蛋白水解产生小分子肽。而酶法则是利用酶制剂对胶原蛋白进行剪切使其分解成小分子肽。化学法反应剧烈，难以控制，而且在提取过程可能残存有机溶剂。#酶解法具有反应条件温和、成本低、安全性高及副产物少等优点，是目前胶原蛋白肽制备最常采用的方法。
胶原蛋白肽酶解制备工艺
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制备工艺说明：
(1)原料选择：主要原料包括鱼皮鱼鳞、猪/牛皮骨等，要求来源新鲜、安全、无污染。
(2)预处理：主要是通过控制温度、酸、碱、盐处理脱脂、脱钙、去杂蛋白，提高胶原蛋白的纯度以保证胶原蛋白肽的纯度；脱脂是去除脂肪；脱钙主要是去除鳞、骨中的羟基磷灰石晶体和无定型磷酸氢钙；去杂蛋白是指去除非胶原蛋白的蛋白部分。
(3)酶解：根据目标胶原蛋白肽的质量参数要求，优化筛选复合酶组合、用量，控制酶解温度、pH值以及酶解时间进行高效酶解，达到酶解终点后通过升温或调节pH值灭酶。
(4)精制分离：通过活性碳或其他吸附剂选择性吸附脱色、去除腥味与涩味，通过粗滤、离心分离与板框过滤除去杂质和吸附剂，过膜分离(微滤、超滤、纳滤)去除色素、异味、盐分以及大分子蛋白和多肽，控制产品的分子量。
(5)浓缩：通过膜浓缩或蒸发浓缩至胶原蛋白肽液浓度至20%～45%，为后续干燥节约能耗、提高效率。
(6)干燥制粒：通过喷雾干燥塔结合造粒机获得胶原蛋白肽粉末或颗粒，控制产品的水分、粒度与流动性。
(7)包装成品：在控温控湿的洁净间(一般要求十万级以上)操作，包装有袋装、桶装、箱装(内包装一般为复合膜)，注意防晒、防雨、防潮。
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